红旗出版社原为求是杂志社直属的公益性文化事业单位，拥有红旗音像出版社、五四书店下属两个法人实体。2009年，根据《中共中央办公厅 国务院办公厅关于深化中央各部门各单位出版社体制改革的意见》（中办发[2009]16号）的要求，经中央各部门各单位出版社体制改革工作领导小组批复同意，求是杂志社和浙江日报报业集团联合重组红旗出版社，率先完成改制任务，成立了红旗出版社有限责任公司，成为中央转制出版社中与地方集团重组的第一家出版社。

新公司成立后，以科学发展观为指导，抓住重塑文化市场主体这个中心环节，处理好存量改造、盘活与增量创新、扩张的关系，整合优势资源，推进体制机制创新，力争经过若干年努力，将红旗出版社打造成为全国一流的以政治经济出版物为特色的国家级出版企业，并以此为平台，融合网络、数字、电子传媒等资源，进一步发展成为适应时代要求和全新运营模式的有广泛影响的多媒体出版企业。

目前，新红旗公司的已经推出了《提问2010》、《提问G20》、《提问十二五》、《思考中国》、《马云内部讲话》、《冰与火——中国股市记忆》、《风云记——吉利收购沃尔沃》等一批精品图书，受到市场强烈反响。在今年建党九十周年之际，红旗出版社陆续推出一批庆祝建党90年精品图书，其中《信仰的力量（三卷本）》、《与信仰对话——提问党史青年读本》、《建党伟业》入选中宣部、新闻出版总署庆祝建党90周年重点推荐书目，并被列入“全国百家书城庆祝建党九十周年重点展示展销书目”。红旗出版社在建党九十周年的精彩亮相以及受到的各方好评，这反映了红旗出版社在体制机制改革创新后迅速迸发活力，以昂扬奋发的精神面貌，多出快出好书，呈现出了生机勃勃、团结向上的发展态势。